2008./2009. mācību gadā Daugavpils 4. speciālo pamatskolu pārcēla uz Daugavpils 11. pamatskolas telpām un pēc tam 2011. gadā likvidēja. Speciālās skolas ēka ir slēgta un netiek izmantota, tikai pagājušajā mācību gadā tā bija nodota Daugavpils Valsts tehnikumam uz viņu telpu renovācijas laiku.
2010. gadā tika likvidēta Daugavpils pilsētas Jaunatnes skola, kas atradās pilsētas Izglītības pārvaldes telpās. Tagad tās izmanto Daugavpils pilsētas Izglītības pārvaldes Iekļaujošās izglītības atbalsta centra vajadzībām.
Tajā pašā gadā notika Daugavpils 5. pamatskolas un Daugavpils Centra ģimnāzijas reorganizācija, 5. pamatskolu pievienojot Centra ģimnāzijai, kas pirms trim gadiem pārtapa par Centra vidusskolu. Daugavpils 5. pamatskolas ēka tika nodota Daugavpils dizaina un mākslas vidusskolai “Saules skola” uz tās remontdarbu laiku. Arī pašlaik šīs ēkas daļu izmanto “Saules skola”, bet otra daļa sakarā ar remontdarbiem ir nodota PIKC Daugavpils Būvniecības tehnikumam.
2010. gadā notika arī Daugavpils 7. pamatskolas un 16. vidusskolas reorganizācija, 7. pamatskolu pievienojot Daugavpils 16. vidusskolai, kā arī Daugavpils 8. pamatskolas pievienošana J. Raiņa Daugavpils 6. vidusskolai. Abu bijušo skolu – 7. pamatskolas un 8. pamatskolas – ēkas slēgtas un šobrīd netiek izmantotas.
Daugavpils pilsētas Izglītības pārvaldes Izglītības atbalsta nodaļas vadītāja Lidija Plavinska informē, ka patlaban tiek gatavots domes lēmuma projekts par to bijušo izglītības iestāžu ēku, kuras netiek izmantotas, nodošanu no Daugavpils pilsētas Izglītības pārvaldes bilances Daugavpils pilsētas domes bilancē.
Lai sistemātiski un ekonomiski sakārtotu Daugavpils pilsētas izglītības iestāžu tīklu, nodrošinot ēku racionālu izmantošanu un pirmsskolas izglītības un audzināšanas kvalitāti, pieejamību un daudzveidību, kā arī sanitārajām un drošības prasībām atbilstošu fizisko vidi, veselīgu un pilnvērtīgu uzturu un kvalificētu personālu, šāgada 26. februārī tika lemts pievienot Daugavpils 6. pirmsskolas izglītības iestādi J. Raiņa Daugavpils 6. vidusskolai. Pie skolas būs atvērtas trīs bērnu grupas, kas realizēs mazākumtautību pirmsskolas izglītības programmu. Ieguvumi no šīs pārcelšanas: modernas, izremontētas, plašas, atsevišķas un mūsdienīgas rotaļu telpas un guļamistabas katrai grupai; telpa pasākumu organizēšanai; skolas speciālistu (logopēda, sociālā pedagoga, psihologa) profesionālo konsultāciju un palīdzības saņemšanas iespēja; skolas telpu, tajā skaitā zāles, izmantošanas iespējas; pieeja Pārdaugavas bibliotēkas fondiem; iespēja apmeklēt un darboties J. Raiņa skolas muzejā; iespēja apmeklēt skolas brīvā laika klubu; jauns un plašs rotaļu laukums; vecākiem – ērti piebraucamie ceļi; skola, kur mācās vecākie bērni, taču nodalīti, lai neapdraudētu un netraucētu pirmsskolniekus; ES prakses pārņemšana – moderna, ilgtspējīga, perspektīva izglītības iestāde mikrorajonā; tiek saglabāts pedagoģisko darbinieku likmju skaits; racionālāk izmantots tehniskais personāls; ekonomija uz kurinātāja un sarga maiņu darba nodrošinājumu un apkures materiāla iepirkumu; uzlaboti personāla darba apstākļi; nodrošināta izglītības pēctecība (pirmsskola – sākumskola – pamatskola – vidusskola); samazinās izmaksas uz vienu izglītojamo; J. Raiņa Daugavpils 6. vidusskolas telpas tiek optimālāk noslogotas, ilgtspēja skolai konkrētajā, specifiskajā privātmāju apbūves mikrorajonā.
Beidzamajos gados Daugavpilī nav atvērta neviena jauna izglītības iestāde, bet 2009. gadā, lai palielinātu vietu skaitu bērnudārzos, tika dibināta Daugavpils 13. pirmsskolas izglītības iestāde. Šobrīd tajā darbojas piecas bērnu grupas.
Šīsvasaras ieguvums gan lielākiem, gan pavisam maziem daugavpiliešiem ir 1. jūlijā atklātais bērnu zinātkāres centrs “Zili brīnumi”, kas iekārtots bijušā kinoteātra “Renesanse” telpās. Centru ar Daugavpils pilsētas domes līdzdalību un finansiālu atbalstu veido biedrība “V.I.U.C”. “Zili brīnumi” piedāvā uz zinātnes principiem balstītu interaktīvu ekspozīciju un iespējas pašiem izmēģināt dažādas tehnoloģijas un pārbaudīt dabas likumus.