Zilupes novadā nav likvidēto izglītības iestāžu, tikai Pasienes pamatskola ir pārveidota par Zilupes vidusskolas struktūrvienību.
Ar Zilupes novada domes 2010. gada 26. marta lēmumu Pasienes pamatskola reorganizēta, un kopš 2010. gada 1. jūlija izveidota Zilupes vidusskolas struktūrvienība – Pasienes pamatskola. Tā atrodas Zilupes novada Pasienes pagasta Pasienē 12 km attālumā no Zilupes vidusskolas un darbojas saskaņā ar Zilupes vidusskolas nolikumu.
Pirms trim gadiem atklāts bērnu un jauniešu centrs “Zilupe”.